I januari 2024 anklagades UNRWA för att anställda skulle ha kopplingar till Hamas. Det är anklagelser som fick en rad medlemsländer att pausa sitt finansiella stöd, däribland Sverige. Med anledning av anklagelserna tillsatte FN en oberoende utredning i februari 2024. Utredningen fastslog att UNRWAs arbete är avgörande för att leverera humanitär hjälp till palestinska flyktingar i Gaza och på Västbanken. Efter en ytterligare FN-utredning konstaterades att nio UNRWA-anställda kan ha varit inblandade i Hamas attack mot Israel den 7 oktober 2023. Utredningen fastslog inte att dessa var inblandade i attacken men att det framkommit information som “kan tyda på” inblandning.  I de fall där UNRWA inte helt kunde avfärda misstankar om inblandning i attacken den 7 oktober avskedades dessa medarbetare, det vill säga trots att något fastställande inte kunnat ske.

Att UNRWA anklagats för att ha kopplingar till terrorism och korrupation är inte något nytt eller något som började efter 7 oktober 2023, utan handlar om en långt pågående taktik av Israel för att smutskasta UNRWA. Det har därför gjorts flera oberoende utredningar, bland annat två stycken efter den 7 oktober 2023. Utredningarna konstaterar att UNRWA inrättat ett betydande antal mekanismer för att säkerställa efterlevnaden av de humanitära principerna, med tonvikt på principen om neutralitet. Det konstateras också att UNRWA har mer utvecklade mekanismer och principer för detta än andra FN-organ. Bland annat förser UNRWA regelbundet Israel med listor över anställda, och den israeliska regeringen har inte meddelat UNRWA om någon eventuell oro eller misstanke vad gäller listorna sedan 2011. 

Misstankar om kopplingar till terrorism har avfärdats av oberoende utredningar. Därtill har UNRWA fortsatt vidtagit en rad åtgärder för att garantera detta, och jobbar kontinuerligt för att säkerställa neutralitet. Utredningar har inte heller funnit några kopplingar till antisemitiska skolböcker.